商标注册人的权利主要是指对注册商标所享有的专用权。商标专用权包括注册商标的专有使用权、禁止权、转让权、许可使用权和续展权等。

其中最重要的是专有使用权和禁止权。商标专有使用权，是商标注册人在国家商标总局核准的商品或服务项目上使用其注册商标的权利。

商标禁止权，是指商标注册人可以禁止其他单位和个人，未经许可擅自在与其核准商品或服务项目相同或类似的商品或服务上使用与注册商标相同或近似的商标的权利。

法律依据：《商标法》第三条：经商标局核准注册的商标为注册商标，包括商品商标、服务商标和集体商标、证明商标；商标注册人享有商标专用权，受法律保护。