公司法人治理结构存在的问题如下：

(一)公司内部人员控制现象严重。

(二)股权集中于大股东，中小股东利益很难保证。

(三)监事会不能发挥应有的职能。

(四)激励约束制度问题严重。

【法律依据】

《公司法》第二十条，公司股东应当遵守法律、行政法规和公司章程，依法行使股东权利，不得滥用股东权利损害公司或者其他股东的利益；不得滥用公司法人独立地位和股东有限责任损害公司债权人的利益。

公司股东滥用股东权利给公司或者其他股东造成损失的，应当依法承担赔偿责任。

公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。