股东协议和公司章程的法律关系：公司设立协议与公司章程的目标是一致的，都是为了设立公司。两者在法律性质和功能上，还有很大的差别：

(一)公司章程是公司必备文件，而公司设立协议则是任意性文件。

(二)公司设立协议与公司章程的效力范围不同。

(三)公司设立协议与公司章程的效力期限不同。

【法律依据】

《公司法》第十一条，设立公司必须依法制定公司章程。公司章程对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有约束力。