医保甲类药物和乙类药物的区别包括：
1、报销比例不同。甲类药物费用由医疗保险基金全部报销，乙类药物费用由参保人承担部分，剩下部分由医疗保险基金报销。
2、概念不同。甲类药物是指全国基本统一、能保证临床治疗最基本需要的药物。乙类药物是可供临床治疗选择使用，疗效确切、同类药品中比“甲类药品”价格或治疗费用相对略高的药品。
3、价格不同。甲类药物同类药品中价格较低，由国家统一制定，各地不得调整；乙类药物同类药品中比甲类药物价格略高，由国家制定，各省、市、区根据当地经济水平、医疗需求和用药习惯适当进行调整。
4、标记不同。甲类药和乙类药都是属于非处方类药品，并且拥有特有标志OTC，甲类药OTC标识为红色标记，而乙类药OTC标识为绿色标记。
5、销售渠道不同。甲类药必须在药店出售，而乙类药除了可以在药店出售，还可在药监部门批准的宾馆、商店的商业企业中零售。
6、其他。

【法律依据】

《中华人民共和国社会保险法》第二十八条
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。