一般来说医院都可以办健康证的，但最好但你所在城市政府指定专门办的地方（可以通用），如疾病预防控制中心。

因为有的企业会有指定医院的要求（控制中心办的除外），其它的医院它不认可。

健康证在所在的卫生局卫生监督所办理，具体程序：

一、办理健康证前先进行健康查体。

1、带身份证和个人免冠一寸彩色照片2张，领取体检表到，收费处缴纳体检费，粘贴照片（另一张领健康证用）、填写好姓名、性别等基本情况。

2、检验室采血、大便肛拭化验。

3、内、外科常规体检。

4、x光胸透。

5、完成全部体检项目。

二、查体结果符合发放健康证条件的，查体结果不符合发放健康证条件的，不予办理健康证。经卫生监督机构组织的卫生法律法规知识培训合格后，将本人正面免冠彩色照片到所管辖的卫生局卫生监督所办理健康证明。

【法律依据】

《中华人民共和国传染病防治法》第五条，各级人民政府领导传染病防治工作。县级以上人民政府制定传染病防治规划并组织实施，建立健全传染病防治的疾病预防控制、医疗救治和监督管理体系。