商铺的土地使用权年限到期后的处理方式如下：

1、根据国家现在对商铺土地使用权的规定，商铺土地使用权年限40年或服务土地使用年限70年到期后自动续约。

2、商铺土地的所有权是国家的，我们只是有商铺使用权，商铺的40年也就是指商铺的土地的使用权年限，到期的只是商铺土地租用时间，不是房产。

到时候可以继续缴纳商铺的土地出让金即可重新取得房屋土地使用权。

3、土地如果到期，所有人具有优先向国家申请延续商铺土地使用权的权利；

如果国家没有商铺拆迁计划，则该商铺土地可以由原所有人按照现行的土地价格，交纳商铺土地出让金以继续使用土地。

4、如果国家有商铺的拆迁计划，则无偿征用土地并且对地上物做价补偿。

5、商铺的所有权永久属于购房者。

【法律依据】

《中华人民共和国城市房地产管理法》第二十一条规定，办理土地使用权续期的，应当重新签订土地使用权转让合同，并依照规定支付土地使用权出让金。