对于已确诊的员工以及在观察期和隔离期的员工考勤方法为：

1、对已确诊的员工，在患病期间，不得解除劳动合同，医疗期内企业支付的病假工资标准不得低于最低工资标准的80%;企业职工因患病或非因工负伤医疗期满后，用人单位不得立即与劳动者解除劳动合同关系。

2、对于观察期、隔离期的员工应按“出勤”执行。

【法律依据】

根据《劳动法》第二十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依据本法第二十六条、第二十七条的规定解除劳动合同：

(一)患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的;

(二)患病或者负伤，在规定的医疗期内的;

(三)女职工在孕期、产期、哺乳期内的;

(四)法律、行政法规规定的其他情形。

根据《传染病防治法实施办法》第四十九条，甲类传染病疑似病人或者病原携带者的密切接触者，经留验排除是病人或者病原携带者后，留验期间的工资福利待遇由所属单位按出勤照发。