民事经济纠纷的处罚方法：

(一)申请经济仲裁，当出现经济合同纠纷，企业可以申请经济合同仲裁。经济合同仲裁是由国家规定的经济合同仲裁机关依法对当事人之间的经济合同纠纷居中调解，依法作出判断或裁决的活动。

(二)进行经济诉讼，经济诉讼是指国家司法机关，按照法律的规定，审理经济纠纷案件并依法作出判决的活动。

【法律依据】

《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。