股权转让协议是以股权转让为内容的合同，股权转让是合同项下债的履行。

股权转让协议纠纷起诉管辖法院以《民事诉讼法》相关规定为基础综合考虑其他因素，审判原则应把握好处理股权转让纠纷与坚持商法理念的关系，优先适用商法规则，民法规则补充适用。

因股权转让纠纷提起的诉讼，原则上以《民事诉讼法》中管辖的相关规定为基础，按照我国《民事诉讼法》及最高院司法解释的规定。审判原则应把握好处理股权转让纠纷与坚持商法理念的关系，优先适用商法规则。把握处理好“内”与“外”的关系，坚持“内外有别”。股权的性质决定了股东处分自己的股权是必然涉及其他股东的利益，因此在处理股权转让纠纷中，首先要处理外部关系，然后再处理内部关系。