二手小产权房屋买卖纠纷有：

1、定金纠纷，合同签订时定金一定要以书面的形式进行约定才有法律效力。定金的约定要全面，特别是对定金退回的适用情况进行明确的说明。

2、一房二卖的纠纷，一房二卖就是售房者将同样的房子卖给两个人。

3、可能会出现承租人主张优先购买权，而导致原先的买卖合同无效的纠纷。

【法律依据】

《中华人民共和国城市房地产管理法》第三十八条，下列房地产，不得转让：

（一）以出让方式取得土地使用权的，不符合本法第三十九条规定的条件的；

（二）司法机关和行政机关依法裁定、决定查封或者以其他形式限制房地产权利的；

（三）依法收回土地使用权的；

（四）共有房地产，未经其他共有人书面同意的；

（五）权属有争议的；

（六）未依法登记领取权属证书的；

（七）法律、行政法规规定禁止转让的其他情形。