全职妈妈离婚有两个孩子会根据父母身份的抚养能力、经济能力、有利于孩子成长等各方面综合考虑之后，判决由一方抚养；或者是一方抚养一个或两个都随一方生活的方式，不直接抚养孩子的应当给付抚养费。

【法律依据】

《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。